org-mode – flujo de trabajo de zotero en emacs?

Pregunta:

¿Existe alguna función que la gente utilice para exportar texto sin formato a emacs orgmode como parte de su flujo de trabajo de investigación para organizar sus enlaces y anotaciones? Escuché que zotxt es útil, ¿alguien tiene alguna opinión al respecto o sobre algo mejor?

Respuesta:

No hay una sola herramienta, pero existen numerosos paquetes que pueden ser útiles si usa Zotero y Emacs uno junto al otro. Hay varios tutoriales en línea que discuten la configuración de combinaciones de estos al gusto del autor individual.

En lugar de repetirlos, intentaré dar una descripción general, ya que su pregunta no tiene del todo claro qué le gustaría hacer.

"Flujo de trabajo de investigación"

Considere primero que el "flujo de trabajo de investigación", en lo que respecta a la literatura de investigación, tiene varios pasos, tales como:

  1. Agregar elementos bibliográficos (artículos, libros, lo que sea)
  2. Editar los datos bibliográficos de los ítems
  3. Etiquetar, agrupar y vincular elementos
  4. Administrar archivos (por ejemplo, PDF) asociados con elementos
  5. Crear notas sobre elementos
  6. Búsqueda de datos y notas bibliográficas
  7. Insertar citas en documentos mientras escribe (sus propios artículos)
  8. Resolución de citas en referencias en línea, notas a pie de página y bibliografías para su publicación.

En Zotero "estándar", Zotero hace 1 a 6, y el plug-in del procesador de texto Zotero hace 7 y 8.

Sugiero pensar primero en lo que quiere que haga Emacs y lo que le gusta de Zotero. Puede administrar bibliografías y escribir artículos científicos completamente dentro de Emacs; mucha gente lo hace. En lugar de la base de datos de Zotero, la información bibliográfica se almacena en un archivo Bib (La) Tex ( .bib ) y las citas se agregan a los archivos LaTeX, org o markdown.

Pero en mi opinión, Zotero tiene fortalezas particulares en 1-4 (agregar y administrar datos) y en 6 (tiene una herramienta de búsqueda muy rápida y poderosa). Anotar (5) es relativamente débil, porque el editor de texto simple es incómodo si está acostumbrado a Emacs. Y si escribe sus propios artículos en Emacs, necesita algo que haga las tareas 7 y 8.

Algunos paquetes

Introducir datos en emacs

Si está usando Emacs en paralelo con Zotero, Emacs necesita alguna forma de ver lo que tiene en su base de datos. La mejor manera de hacer esto es exportar un archivo .bib , para cuyo formato Emacs tiene un amplio soporte, de Zotero.

Esto se puede hacer manualmente, pero paquetes como zotelo o la bifurcaciónemacs-zotero-bib-fetch le permitirán mantener rápidamente .bib archivo .bib desde dentro de Emacs. zotelo requiere Mozrepl, que actualmente no es compatible con Firefox Quantum, por lo que recomiendo usar emacs-zotero-bib-fetch .

Ver datos dentro de emacs

Una vez que tenga un archivo .bib , el paquete incorporado reftex , así como org-ref y helm-bibtex le permitirán buscar sus datos bibliográficos. Es probable que uno o ambos de estos últimos paquetes sean muy útiles; realizan una serie de tareas de la lista anterior, incluidas las facilidades para tomar notas.

PDF y anotarlos

helm-bibtex es particularmente inteligente para encontrar archivos PDF vinculados a elementos bibliográficos, que luego puede abrir en Emacs. pdf-tools es un excelente visor de PDF alternativo dentro de Emacs. Le permite ver y crear anotaciones dentro del archivo PDF. Si le gusta usar archivos PDF de esta manera, la extensión zotfile para Zotero puede extraer anotaciones automáticamente en una nota de Zotero.

Archivos de nota

helm-bibtex y org-ref tienen instalaciones para agregar notas a elementos bibliográficos. Estos se almacenan como archivos org.

Una vez que he terminado mis notas sobre un elemento, hago Cc Ce ho para exportar una versión HTML y copiar y pegar esto en Zotero como una nota para que se pueda buscar. No he encontrado una manera más hábil de hacer esto.

Insertar y resolver citas mientras se escribe

Esto depende en parte del formato que escriba (org, reftex, markdown) y en parte depende del formato que desee al final (PDF, HTML).

Nuevamente, tanto helm-bibtex como org-ref , así como reftex permiten insertar citas en los documentos que está escribiendo de cualquiera de estos tipos.

Suponiendo que está escribiendo en org, existe (todavía no) una sintaxis de citas estándar, pero org-ref proporciona una. Otras personas simplemente usan los comandos de citas de LaTeX directamente en org.

Si su objetivo de salida principal es PDF, entonces la propia exportación org-mode (a través de LaTeX) es probablemente la ruta más fácil.

Mencionas zotxt ; No lo he usado, pero parece ser una herramienta para resolver y formatear citas en archivos de texto sin formato, incluida la compatibilidad con pandoc . Rebaja Pandoc tiene un formato de cita estándar y el apoyo para la resolución y el formato bibliografías (usando CSL). Pandoc puede ser preferible si desea exportar principalmente a múltiples formatos (por ejemplo, HTML, markdown).

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